C’est OSF (Open Science Framework), du Center Open Science Charlottesville, USA, qui vient de mettre en ligne de bonnes ressources. COSIG veut dire Collection of Open Science Integrity Guides. Il s’agit d’une collection de 28 guides, mis à jour le 13 juin 2025, et la compilation PDF fait 163 pages. J’ai regardé la moitié des 28 guides, et celui sur les références est excellent, comme bien d’autres. Ces guides sont des aides pour mettre des commentaires sur PubPeer par exemple. Ces guides font environ de 5 à 7 pages et ils contiennent les meilleurs références sur le thème.
However, investigating the integrity of the published scientific literature often requires domain-specific knowledge that not everyone will have. This open source project is a collection of guides written and maintained by publication integrity experts to distribute this domain-specific knowledge so that others can participate in post-
publication peer review.
14 ‘General guides’
Le premier guide ‘PubPeer commenting best practices‘ aide pour bien commenter un article, avec des exemples de commentaires inutiles et quelques bons conseils. Le guide ‘Ethical approval of human subjects research‘ est très complet, bien fait dans un contexte international/nord américain. Parmi les exemples sur ‘Re-used ethical approval number, lack of local approval, lack of informed consent’, ce sont les performances de l’IHU de Marseille qui sont citées ! BRAVO. Dans la coercition, il y a cet exemple “information provided by the Authors has indicated that a police officer may have been present as part of the team collecting blood samples and the Editors have concerns that this may have compromised the freedom of participants to give their consent to participate voluntarily‘. Le guide ‘Citations‘ liste toutes les situations bizarres et il est très très complet !!!
Voici les 14 guides : PubPeer commenting best practices ; Extracting vector graphics from a PDF ; The vertical line test ; Image duplication ; Image compression artifacts ; Software for image forensics ; Reporting publication integrity issues to publishers ; Citations ; Citations to retracted publications ; Formulaic research ; Plagiarism of text ; Common dismissive responses to integrity concerns ; Suspicious venues ; Ethical approval of human subjects research
4 guides ‘Biology and Medicine’
Ils sont clairs, et le guide ‘Nucleotide sequence reagents‘ permet de mieux comprendre un sujet complexe (pour moi !). Voici les quatre guides : Antibody validation ; Misidentified and non-verifiable cell lines ; Nucleotide sequence reagents ; Tumor burden. Ce dernier guide sur les tumeurs est didactique.
5 guides ‘Materials sciences and engineering’
Les voici, sans commentaires, : X-ray diffraction patterns – Scherrer’s equation ; X-ray diffraction patterns – data duplication ; Energy dispersive X-ray spectroscopy ; Elemental composition ; Tauc plots
5 guides ‘Mathematics, statistics and computer science’
Les voici, sans commentaires, : Evaluating the performance of binary classifiers ; Evaluating the performance of multiclass classifiers ; Granularity-related inconsistency of means (GRIM) ; Standard deviation versus standard error ; Multiple hypothesis correction. Celui sur les déviations standard est bien, didactique, avec exemples.
